合同纠纷的处理方式有以下几种：
1.当事人应本着“互谅、互让”的精神，自愿协商解决。这种解决纠纷的方式，无须任何第三人介入，既有利于及时解决纠纷又有利于双方当事人的团结，有利于维护企业间长期建立起来的协作关系。因此，纠纷发生后，当事人应把“协商”作为解决纠纷的首选途径。
2.第三人居中调解。合同发生纠纷，当事人可以请协议条款约定的单位或人员居中进行调解。这种调解不同于仲裁程序和诉讼程序中以调解方式结案的调解。
3.向仲裁委员会申请仲裁。合同的双方当事人如果不愿意协商、调解或协商、调解不成的，可以仲裁或诉讼。
4.向人民法院起诉。合同发生纠纷后，当事人自行协商、调解不成的，合同中又没有仲裁条款，事后又没达成仲裁协议的，则可以向人民法院起诉。我国《民事诉讼法》规定，工程承包合同由工程所在地人民法院管辖。人民法院收到起诉状，经审查，认为符合起诉条件的，依法组成合议庭进行审理。仲裁和诉讼这两种途径，当事人只能选择其一。
