申请劳动仲裁时公司注销，可按以下方式处理。若公司未经依法清算即办理注销登记，劳动者可将公司的股东、发起人或者出资人列为被申请人，要求其承担清偿责任。因为股东等对公司负有清算义务，未依法清算就注销损害了劳动者权益。若公司是经过合法清算后注销，且清算时对劳动债权进行了处理，一般不再追究。但如果清算过程存在瑕疵，如未依法通知劳动者申报债权等，劳动者仍可要求相关责任人承担责任。劳动者应收集公司注销、股东身份等相关证据，通过仲裁或诉讼维护自身权益。
二、申请劳动仲裁申请人败了如何处理
若劳动仲裁申请人败诉，可依情形处理。若对仲裁裁决不服，且该裁决属非终局裁决，申请人可自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，通过诉讼程序进一步主张权益，由法院重新审理判定。 若为终局裁决，用人单位不能起诉，但申请人不服仍可在十五日内向法院起诉。若既未在规定时间内起诉，裁决生效后，申请人应接受裁决结果。若认为仲裁程序存在违法违规等影响公正裁决的情况，可收集证据申请撤销仲裁裁决。
三、申请劳动仲裁如何进行
申请劳动仲裁，需按以下步骤进行。首先，确认仲裁范围，如因劳动合同、劳动报酬、工伤医疗费等发生的争议。其次，准备材料，包括仲裁申请书，要写明双方信息、仲裁请求及事实理由；申请人身份证明；被申请人的注册登记资料；证据材料，如劳动合同、工资条等。然后，向有管辖权的仲裁委员会提交申请，一般是劳动合同履行地或者用人单位所在地的仲裁委员会。仲裁委在收到申请后五日内决定是否受理。受理后，会安排开庭时间并通知双方。开庭时，当事人需举证、质证、辩论。最后，仲裁委作出裁决，一般在受理后四十五日内结束，案情复杂可延长十五日。
当面临申请劳动仲裁时公司注销了的情况，确实会让人感到棘手。不过别慌，即便公司注销，劳动者的权益仍有保障途径。比如，可向公司的股东、发起人或出资人主张权利，要求其承担相应责任。若公司注销存在瑕疵，如未经合法清算等，相关责任人也需对劳动者的权益负责。要是你正为此事烦恼，对如何具体向相关方主张权益、怎样确定责任范围等问题存有疑问，那就赶紧点击网页底部的“立即咨询”按钮吧。专业法律人士会依据具体情况，为你提供精准有效的解决方案，全力维护你的合法权益。
