抵押房屋拆迁纠纷的处理方式：以建筑物抵押的，该建筑物占用范围内的建设用地使用权一并抵押。以建设用地使用权抵押的，该土地上的建筑物一并抵押。如果抵押的房屋被拆迁的，当事人可以重新订立抵押合同，协商不成的，也可以向人民法院提起诉讼。
《民法典》第三百九十七条
以建筑物抵押的，该建筑物占用范围内的建设用地使用权一并抵押。以建设用地使用权抵押的，该土地上的建筑物一并抵押。
抵押人未依据前款规定一并抵押的，未抵押的财产视为一并抵押。
二、抵押房屋拆迁补偿如何处理
在抵押房产进行拆迁的情况下，倘若选择货币赔偿的方案，首要步骤是由抵押权人和抵押人重新确立抵押权或者完全偿清债务。
只有在抵押权彻底消除之后，被拆迁方才有资格从拆迁方那里获取相应的补偿资金。
然而，若出现抵押人和抵押权人未能达成新的抵押协议或者无力按时偿还所欠债务的状况时，拆迁方有权暂时停止支付拆迁补偿款。
房屋征收部门应当对房屋征收范围内房屋的权属、区位、用途、建筑面积等情况组织调查登记，被征收人应当予以配合。调查结果应当在房屋征收范围内向被征收人公布。
第十六条
房屋征收范围确定后，不得在房屋征收范围内实施新建、扩建、改建房屋和改变房屋用途等不当增加补偿费用的行为；违反规定实施的，不予补偿。
房屋征收部门应当将前款所列事项书面通知有关部门暂停办理相关手续。暂停办理相关手续的书面通知应当载明暂停期限。暂停期限最长不得超过1年。
抵押房屋拆迁纠纷的处理方式：以建筑物抵押的，该建筑物占用范围内的建设用地使用权一并抵押。以建设用地使用权抵押的，该土地上的建筑物一并抵押。如果抵押的房屋被拆迁的，当事人可以重新订立抵押合同，协商不成的，也可以向人民法院提起诉讼。
