1、农用地转用必须符合土地利用总体规划、城市建设总体规划和土地利用年度计划，首先向国土资源局、建设部门、规划部门咨询该农用地是否符合上述的各项规划。
2、确认该农用地可以用于建设，再根据建设部门的要求，进行和编制建设项目可行性论证，向建设部门提交用地申请，建设部门审查符合的;颁发建设项目的《选址意见书》，用地单位应按规定缴纳选址规费。
3、用地单位持该《选址意见书》向同级国土资源局提出用地预审申请，由该国土资源局核发《建设项目用地预审报告书》。
4、用地单位凭《建设项目用地预审报告书》向建设部门、环保局等办理立项、规划、环保许可等手续，并缴纳各项审批费用。
5、用地单位再持以上审批文件，向原预审的国土资源局提出项目用地的正式申请。
6、国土资源局根据土地利用总体规划、城市建设总体规划和土地利用年度计划，拟定农用地转用方案、补充耕地方案、征地方案和供地方案，分不同类型，经各级人民政府审批。
农村办小厂申请用地主要是由村委会负责的，符合法定条件的村委会应当依法出具相关的审批意见，随后再到市县级人民政府办理农用地转用审批。没有经过审批随便在农用地上修建工厂属于违法占地，要承担法律责任，非法占用农用地情节严重的会被判刑。
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