区分分裂国家罪与非罪行为的界限，要注意以下两点：
一是行为人是否具备分裂国家、破坏国家统一的直接故意;
二是是否具有组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一的行为。
如果出于狭隘的民族主义或地方主义情绪，或者出于对国家某些民族政策的误解而实施了一些过激的行为，或者虽有一些思想上的分裂倾向，而缺乏任何具体的组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一的行为，都不应以本罪论处。
应当注意的是，分裂国家罪是行为犯，只要行为人实施了组织、策划、实施分裂国家、破坏国家统一的行为，就可以构成本罪的既遂，而不要求发生实际的危害结果。关于分裂国家罪的犯罪主体，从实践中看，通常主要是一些身居要职的野心家、阴谋家，以及具有一定社会影响力的地方分裂主义分子和民族分裂分子。
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